Obecně to souvisí s pokrokem v poznání. Tak jak se vyvíjela atomistika "a byl objeven" proton (spíš na něj byla vytvořena teorie), tak bylo výhodnější opustit atomové váhy a přejít k protonovým číslům.
Protože seřazení podle počtu protonů v jádře dává ve sloupcích stejné konfigurace valenčních orbitalů a tudíž podobné chemické vlastnosti. Seřazení podle hmotnosti vytváří chyby v periodičnosti, známé je prohození I a Te ve staré tabulce.
