Ono je to složitější, na řízení reflexů se více či méně podílí celá CNS, ale těžiště řízení reflexů je záležitost míchy a šedé kůry mozkové, ostatní části mozku jako například epitalamus, talamus nebo hypotalamus a části velkého mozku jako Brocovo nebo Wernickeovo centrum řeči, centrum sluchu či zraku se podílí pouze jako vodiče vzruchu.