Celé to souvisí se strukturou samotného enzymu. Enzym se skládá z bílkovinné části tzv. apoenzymu a nebílkovinné části tzv. kofaktoru. Kofaktor + apoenzym vytváří celek zvaný HOLOENZYM. Vrátíme se k té nebílkovinné části, tedy ke kofaktoru. Kofaktor může mít charakter 1. Prostetické skupiny (ta je vázána pevnou kovalentní vazbou) nebo 2. Koenzymu (k bílkovinné části jsou navázány mnohem slaběji, mohou se dokonce oddisociovat, je nezbytná pro průběh reakce, ale snadno se uvolní, jedná se de facto o disociabilní molekulu). Mezi příklady koenzymů jsou vitamíny, ionty kovů, často i fosfáty.